پژوهشگران موسسه معارف وحیانی ثقلین از سال ۱۳۷۸ با هدف تبیین آیات و روایات معارفی که شامل بحث های، اخلاقی اعتقادی سیره معصومان و نیز فلسفه احکام می شود، اقدام به تهیه و تنظیم موسوعه معارف اهل البیتعلیهم السلام کردند.
مهمترین ویژگی‌های این اثر همراه با اپلیکیشن:
۱- تقطیع هدفمند آیات و روایات برای فهم محتوای معارفی آنها، در گام نخست همۀ روایات معارفی کتب اربعه به صورت موضوعی و مفهومی تنظیم و منتشر شد و در مرحله بعدی کار بر روی کتاب بحار الانوار شروع و ۲۰ جلد اول آن به اتمام رسیده است.
۲- آرایش نمایه برداری محتوایی این آیات و روایات به گونه درختواره معارفی.
۳- دسترسی و مشاهده روایات موجود در هر موضوع معرفتی از یک سو و نیز دسترسی سریع به موضوعات معارفی موجود در هر روایت از سوی دیگر.
۴- نشر همزمان یک دورۀ ۱۲ جلدی به همراه اپلیکیشن موسوعه بر روی لوح فشرده.
۵- درج مجموعه مقالات برای فهم کلام معصومین (ع) از قبیل معارف وحیانی و معارف عقلانی، تقیه، نقل به معنا، ولایت تشریعی امامان معصوم قلمرو دین و … در جلد اول موسوعه و نیز فهارس به همراه جدول تطبیقی، نشانی کتاب وافی با کتب اربعه در جلد دوازدهم موسوعه معارف اهل البیت (علیهم السلام) از ویژگی های این موسوعه است.